我会感染衣原体肺炎吗？

不会。
你老公携带的是沙眼衣原体，引起肺炎的是肺炎衣原体。衣原体不引起肠道疾病。
沙眼衣原体所致疾病：
（一）沙眼
（二）包涵体包膜炎
（三）泌尿生殖道感染
（四）性病淋巴肉芽肿

肺炎衣原体所致疾病：
肺炎、支气管炎、咽炎、喉炎和鼻炎