奈替米星的抗菌作用基本上与庆大霉素相似,对大肠杆菌、肺炎杆菌、肠杆菌属、志贺菌属、沙门菌属、沙雷菌属、柠檬酸菌属、铜绿假单胞菌等细菌均有良好的抗菌作用,对肺炎球菌、各组链球菌的抗菌作用较差,对肠球菌属和厌氧菌无抗菌作用。
奈替米星与其他氨基苷类抗生素一样,本品主要适用于严重的革兰阴性杆菌感染,与青霉素类或头抱菌素类联合用于病原菌未明感染的经验治疗。